Conan e i Giovani Detective si imbattono nell'agente Takagi, impegnato nelle indagini su un furto avvenuto in una villa del quartiere. Successivamente, i ragazzi si spostano verso un lago artificiale dove i guardiani sono intenti a recuperare quattro tartarughe esotiche liberate nel parco. L'attenzione di Conan viene catturata da un individuo che osserva le operazioni con ansia ingiustificata, mostrandosi estremamente determinato a entrare in possesso degli animali. Il piccolo detective sospetta che le tartarughe non siano semplici animali domestici abbandonati, ma che possano essere collegate alla refurtiva del caso su cui indaga Takagi, fungendo da insolito nascondiglio per degli oggetti preziosi.