Conan riesce a risolvere il complesso enigma del treno grazie all'intervento risolutivo dei suoi genitori, Yukiko e Yusaku, giunti sul posto per far luce sulla vicenda. Si scopre infatti che l'assassino ha agito seguendo fedelmente la trama di un vecchio manoscritto inedito rubato proprio a Yusaku Kudo poco tempo prima. Identificato il colpevole tra i passeggeri, il celebre scrittore aiuta il figlio a svelare come l'uomo abbia manipolato gli spazi angusti del convoglio per emulare le gesta letterarie del racconto, chiudendo definitivamente il cerchio tra realtà e finzione.