Ran e Conan soccorrono un uomo disperato per la sparizione della moglie Tomoko, svanita nel nulla da settantadue ore. Il caso viene affidato a Kogoro che, affiancato dal piccolo detective, avvia una serie di interrogatori tra i residenti del quartiere per ricostruire gli ultimi spostamenti della donna. Tuttavia, l'indagine subisce una svolta macabra: una segnalazione anonima guida la polizia verso l'abitazione del cliente, dove il cadavere di Tomoko viene rinvenuto sepolto nel giardino. Kogoro si ritrova così a dover difendere il proprio assistito dall'accusa di omicidio, mentre Conan analizza la dinamica della telefonata e lo stato del terreno, sospettando che qualcuno abbia meticolosamente incastrato l'uomo.