Conan si confronta con Ai sull'enigmatica espressione "sorellina al di fuori del territorio" riferitagli da Masumi Sera riguardo alla misteriosa bambina bionda. Poco dopo, un narcotrafficante in fuga travolge accidentalmente il piccolo detective, smarrendo un'agenda cifrata colma di codici alfanumerici. Conan intuisce che i simboli corrispondono a sillabe dei nomi delle stazioni metropolitane di Tokyo, ma l'enigma rimane parzialmente indecifrabile. Mitsuhiko decide quindi di coinvolgere Heiji Hattori, il quale realizza che la chiave del codice è mista: una parte dei riferimenti appartiene alla rete ferroviaria di Osaka. Grazie alla collaborazione tra i due detective, il messaggio viene decifrato, rivelando le coordinate spazio-temporali di un imminente e massiccio scambio di droga.