Conan intuisce che la morte dell'uomo non è accidentale poiché il sangue sulla ferita era già rappreso al momento del ritrovamento del corpo. Quando il piccolo detective è pronto a risolvere il mistero, si accorge che Toru Amuro lo sta sorvegliando attentamente, impedendogli di utilizzare l'orologio anestetizzante su Kogoro. Conan è quindi costretto a guidare il detective verso la soluzione tramite suggerimenti mirati, risolvendo il caso sotto l'occhio vigile di Bourbon. Nel finale, Vermouth contatta Amuro sostenendo che la sua missione accanto a Kogoro sia conclusa, dato che Sherry è ufficialmente morta; in questo modo, la donna continua a nascondere all'Organizzazione il fatto che Ai Haibara sia in realtà sopravvissuta all'esplosione del treno.