Ran, Sonoko, Masumi e Conan si riuniscono al bowling, dove Makoto Kyogoku, accecato dalla gelosia, scambia Masumi per un ragazzo e la affronta in un duello di arti marziali. Chiarito l'equivoco, Masumi confessa che il suo primo fratello maggiore, presumibilmente defunto, le ha insegnato il Jeet Kune Do. Conan indaga sull'identità dell'altro fratello con cui la ragazza si consulta spesso: Masumi rivela che si tratta di un secondo fratello, impegnato in una missione segreta, il quale nutre una profonda stima per l'acume di Conan. Quando Masumi insinua che il bambino e Shinichi siano la stessa persona, Conan cerca di sviare i sospetti. La tensione si sposta poi su un fatto di sangue: mentre Makoto riposa in auto, il cadavere di un uomo viene rinvenuto nei bagni del parcheggio, trasformando il pomeriggio in una nuova indagine.