Il rapimento di una compagna di classe di Ran getta la scuola nel panico, soprattutto perché le indagini della polizia sembrano essere giunte a un punto morto. Disperato, il padre della ragazza si rivolge a Kogoro affinché agisca con discrezione per ritrovare la figlia prima che sia troppo tardi. Mentre il detective cerca di negoziare con i sequestratori, Conan analizza i pochi indizi lasciati sulla scena del crimine e i sospetti legami lavorativi del genitore. Grazie al suo acume, il piccolo detective riesce a ricostruire il movente del rapimento e a individuare il nascondiglio del colpevole, orchestrando un piano per liberare l'ostaggio in sicurezza.