Sumiko Kobayashi, l'insegnante dei Giovani Detective, riceve una proposta da un giornalista intenzionato a dedicare un articolo alle imprese investigative dei ragazzi. La notizia riaccende in Conan e Ai l'inquietudine legata al caso di Rena Mizunashi, l'esponente dell'Organizzazione attualmente piantonata in ospedale. Giunti all'appuntamento, Genta scopre con orrore il cadavere dell'uomo all'interno della sua abitazione. Conan coordina le indagini per identificare il colpevole tra i conoscenti della vittima, trovandosi però costretto ad agire con estrema cautela: deve risolvere il mistero senza insospettire la maestra Kobayashi, rimasta profondamente colpita dall'acume innaturale dimostrato dal bambino durante i rilievi della polizia.