Kogoro, accompagnato da Ran e Conan, raggiunge Kanazawa per un appuntamento con un cliente che ha richiesto la massima riservatezza. Una volta arrivati a destinazione, il detective si allontana per l'incontro privato, lasciando ai ragazzi il tempo di visitare le bellezze storiche della città. Mentre Kogoro apprende i dettagli di un incarico che si preannuncia complesso e rischioso, Conan viene colto da un'improvvisa inquietudine: il piccolo detective percepisce distintamente la presenza di qualcuno che li pedina nell'ombra tra i vicoli del quartiere delle geishe. Inizia così una silenziosa sfida di nervi tra Conan e il suo misterioso inseguitore, mentre l'indagine di Kogoro si rivela essere legata a un segreto gelosamente custodito dalla comunità locale.