Il monaco scomparso viene finalmente ritrovato, ma la macabra scoperta del suo cadavere getta un’ombra ancora più cupa sul tempio. Nel frattempo, l’apprensione per Kogoro cresce: del detective non c’è ancora traccia. Gli abitanti del luogo sono pronti a giurare che si tratti della "maledizione dello scheletro cremisi", ma Conan ed Heiji non credono all'intervento del sovrannaturale. I due detective devono analizzare i passaggi segreti della struttura per rintracciare Kogoro prima che sia troppo tardi, convinti che l'assassino stia usando la leggenda del teschio come copertura per una catena di delitti legata a un segreto sepolto tra le mura del tempio.