I Giovani Detective offrono il loro aiuto a una coppia intenta a ristrutturare una suggestiva abitazione tradizionale. Tuttavia, i lavori si interrompono bruscamente quando, all'interno di un'intercapedine muraria, viene rinvenuto un cadavere occultato da tempo. La scoperta porta alla luce una fitta trama di misteri collegati tra loro, che affondano le radici nel passato della casa e dei suoi precedenti occupanti. Conan guida i piccoli compagni in un'indagine che intreccia segreti architettonici e vecchi conti in sospeso, sospettando che il delitto sia la chiave per svelare la verità su una sparizione mai risolta e che l'attuale ristrutturazione abbia inavvertitamente disturbato un piano criminale ancora in atto.