Dopo i successi investigativi documentati nei diari di Ayumi e nei taccuini di Mitsuhiko, è finalmente giunto il turno di Genta di guidare la Squadra dei Giovani Detective. L'occasione nasce da un'insolita sparizione legata alla sua pietanza preferita: l'anguilla. Quello che inizia come il semplice furto di una prelibatezza culinaria in un ristorante locale si trasforma presto in un enigma molto più articolato. Conan osserva con curiosità l'approccio istintivo del compagno, lasciandogli il comando delle operazioni. Grazie al suo olfatto infallibile per il cibo e alla conoscenza dei segreti dei ristoratori di Beika, Genta guiderà il gruppo attraverso indizi gastronomici per smascherare il colpevole e risolvere il suo personale mistero delle anguille scomparse.